Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED6P86452 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms