Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX3P78415 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX3P78415 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX3P78415 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms