Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM193AP78312 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms