Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms