Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB2P61812 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB2P61812 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms