Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms