Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTBP60709 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTBP60709 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTBP60709 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms