Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms