Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms