Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB28P51157 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms