Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms