Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM4P49221 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM4P49221 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM4P49221 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms