Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA8P48165 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA8P48165 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA8P48165 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA8P48165 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms