Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms