Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms