Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RANGAP1P46060 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RANGAP1P46060 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms