Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms