Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms