Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCAP28676 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCAP28676 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCAP28676 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms