Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms