Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK11BP21127 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK11BP21127 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms