Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms