Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms