Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A1P13866 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms