Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms