Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH1P12830 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH1P12830 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH1P12830 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH1P12830 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms