Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms