Protein–RNA interactions for Protein: P0DP04

IGHV3-43D, Immunoglobulin heavy variable 3-43D, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-43DP0DP04 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-43DP0DP04 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-43DP0DP04 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-43DP0DP04 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-43DP0DP04 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-43DP0DP04 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGHV3-43DP0DP04 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms