Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMBP08949 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NMBP08949 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms