Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms