Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms