Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC1P02654 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC1P02654 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC1P02654 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms