Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms