Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN2BO60939 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms