Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRNO43815 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRNO43815 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRNO43815 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRNO43815 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRNO43815 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRNO43815 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms