Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms