Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRC1O43663 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRC1O43663 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms