Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRXO43186 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRXO43186 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CRXO43186 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms