Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms