Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOCS1O15524 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms