Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms