Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms