Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QLI3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QLI3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QLI3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QLI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QLI3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms