Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVV-1B6SEH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVV-1B6SEH8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms