Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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