Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALM3A6NDB9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms