Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSDA5PKW4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSDA5PKW4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms