Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCE3A1L190 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCE3A1L190 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms