Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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