Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP110-201ENST00000410146 285 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA6A-201ENST00000257414 4256 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 EFCAB6-201ENST00000262726 4869 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KRTAP9-9Q9BYP9 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms